ÚOCHB

Hmotnostní spektrometrie biopolymerů

Skupina Karla Haranta
Core Facility
BIO cluster

O naší skupině

Servisní skupina Hmotnostní Spektrometrie Biopolymerů (BioMS) poskytuje širokou škálu technik pro „bottom-up“, „top-down“ a strukturní analýzu proteinů a dalších biomolekul. Nabízíme identifikaci a kvantifikaci proteinů z různých biologických vzorků, včetně buněčných nebo tkáňových lyzátů, imunoprecipitátů (IPs) nebo SDS-PAGE bandů. Kvantifikaci proteinů provádíme jak label-free, tak strategiemi se značením (TMT). Dále provádíme analýzu posttranslačních modifikací, včetně globální fosfoproteomiky.

Mezi další poskytované služby patří analýza intaktních proteinů (denaturační) pro potvrzení molekulové hmotnosti proteinů a studium kovalentních modifikací nebo komplexů a nativní hmotnostní spektrometrie pro zkoumání nekovalentních interakcí proteinů, proteinových komplexů a ligandů. Dále nabízíme proteinové zesíťování s hmotnostně spektrometrickou detekcí (crosslinking MS) pro mapování proteinových rozhraní a topologií a vodík-deuteriovou výměnu (HDX-MS) pro zkoumání konformační dynamiky a vazebných míst proteinů a ligandů. Nabízíme také měření iontové mobility pro analýzu rozdílů v tvaru mezi populacemi izobarických molekul ve vzorku nebo analýzu tvaru molekul za různých podmínek.

Poskytujeme konzultace, optimalizaci postupů přípravy vzorků a provádíme analýzu dat. Dále podporujeme výzkumnou činnost ukládáním dat do veřejných repozitářů a pomocí s tvorbou obrázků a textů do výsledných publikací.

Více informací k jednotlivým dostupným typům analýz můžete najít na záložce Servis.

Pro založení nového servisního požadavku náš nejdříve kontaktujte, poté můžete založit požadavek přes (brzy nahrazený) ReQuest systém.

image